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5q欠失症候群
5q欠失関連骨髄系腫瘍
7q欠失関連骨髄系腫瘍
ALK陽性未分化大細胞リンパ腫（ALCL）
B細胞リンパ腫
B細胞性急性リンパ性白血病（B-ALL）
ETV6再構成を伴う造血器腫瘍
EWSR1再構成を伴う軟部腫瘍・骨軟部腫瘍
FGFR1再構成陽性腫瘍
IGH再構成を伴うB細胞性腫瘍
MALTリンパ腫
MALTリンパ腫（粘膜関連リンパ組織型リンパ腫）
MECOM再構成陽性骨髄系腫瘍
Ph陽性急性骨髄性白血病（AML）
バーキットリンパ腫
びまん性大細胞型B細胞リンパ腫（DLBCL）
フィラデルフィア染色体陽性急性リンパ性白血病（ALL）
マントル細胞リンパ腫
マントル細胞リンパ腫など
ユーイング肉腫
一部のB細胞リンパ腫
乳児白血病
各種固形癌
多発性骨髄腫
好酸球増多を伴う骨髄性／リンパ性腫瘍
小児B細胞性急性リンパ性白血病（B-ALL）
急性リンパ性白血病（ALL）
急性前骨髄球性白血病（APL）
急性骨髄性白血病（AML）
悪性黒色腫
慢性リンパ性白血病／小リンパ球性リンパ腫（CLL/SLL）
慢性好酸球性白血病
慢性骨髄単球性白血病（CMML）様疾患
慢性骨髄性白血病（CML）
治療関連白血病
濾胞性リンパ腫
炎症性筋線維芽細胞腫瘍（IMT）
特に CBFB::MYH11 / inv(16) 陽性AML
特に t(8;21) 陽性AML
異性間造血幹細胞移植後の生着確認・キメリズム解析
神経芽腫
節外性辺縁帯リンパ腫
膠芽腫
膵癌
辺縁帯リンパ腫
非小細胞肺癌（NSCLC）
頭頸部癌など
骨髄増殖性腫瘍（MPN）
骨髄異形成症候群（MDS）
骨髄異形成症候群（MDS）関連白血病
高悪性度B細胞リンパ腫
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